L'emergere di un nuovo campo della biologia evolutiva dello sviluppo ("evo-devo") ha stato alimentato dalla scoperta che molti organismi molto lontanamente correlati utilizzano geni molto simili e molecole di stabilire modelli strutturali importanti durante il loro sviluppo (definisce, ad esempio, i confini tra la testa, tronco, addome e coda). L'obiettivo della ricerca in questo campo è quello di determinare i meccanismi evolutivi come (ad esempio, la mutazione e selezione naturale) agire sullo sviluppo embrionale, generare diversità nei piani di vari organismi corpo ma anche vincolare le possibili direzioni di cambiamento evolutivo. Di particolare interesse sono le cosiddette transizioni macroevolutionary, in cui è avvenuto un cambiamento importante nella morfologia, come ad esempio l'emergere di sramatura vertebrati (tetrapodi) dal pesce o l'evoluzione degli uccelli da antenati dinosauri.