A causa dei progressi nei metodi analitici utilizzati per la rilevazione di sostanze chimiche nell'ambiente, livelli di traccia di prescrizione e farmaci da banco sono stati trovati nei corsi d'acqua. Rilevamento di la frequente di molti composti farmaceutici nell'ambiente è stata una crescente preoccupazione a causa del loro potenziale di causare effetti indesiderati ecologici, che possono variare da endocrino nei pesci e animali selvatici per la resistenza agli antibiotici in batteri patogeni. Residui di umana e veterinaria prodotti farmaceutici (come gli antibiotici, gli estrogeni e principi attivi di farmaci) vengono introdotti nell'ambiente attraverso una serie di percorsi, ma soprattutto dagli scarichi di impianti di trattamento delle acque reflue o sbarcare applicazione dei fanghi di depurazione e concime animale. Più attivi di prodotti farmaceutici sono trasformati solo parzialmente nel corpo e quindi sono escreti come un misto di metaboliti e bioattivi forme in sistemi fognari.