L'area di studio incentrato sullo sviluppo di un sistema di classificazione, o tassonomia, per gli impianti di loro relazioni evolutive (filogenesi). Assunzione è che se la classificazione riflette la filogenesi, riferimento alla classificazione aiuterà i ricercatori concentrare il loro lavoro in maniera più accurata. Questo principio è illustrato con l'esempio di una madre e figlia, con un grande affare essere conosciuto circa i tratti genetici della madre. La genetica tratti esposti dalla figlia possono essere in gran parte previsto in questo caso, considerando che per due persone di relazioni sconosciuti non congettura è possibile per quanto riguarda la loro somiglianza genetica. Il compito è quello di rendere la ricostruzione filogenesi precisa possibile. Come questo sistema filogenetico della classificazione è costruito è stata oggetto di diverse opinioni nel corso del tempo. Unità di base della classificazione è generalmente accettato di essere la specie, ma come una specie dovrebbe essere riconosciuta è intensamente dibattuta. Una prospettiva storica è utile per spiegare la natura di questa polemica.